Milijonai neištirtų baltymų gali slėpti naujų antibiotikų užuominas: DI siaurina paiešką

Sekite TechNaujienos Google

„Google DeepMind“ pristatė DI paremtą metodą, kuriuo milijonuose menkai apibūdintų baltymų ieškoma antimikrobinio aktyvumo požymių. Kaip spalio 15 d. paskelbė bendrovė, atrinktas peptidas jau perduotas laboratoriniams tyrimams, kuriais tikrinamas modelio prognozuotas poveikis.

Darbo eiga remiasi „UniProt“ baltymų duomenimis ir „ProtNLM“ prognozėmis apie jų funkcijas. DI agentas „Antigravity“ padeda apdoroti didelį informacijos kiekį ir atrinkti baltymus, kuriuos tyrėjams verta nagrinėti išsamiau.

Projektas orientuotas į nepakankamai ištirtą duomenų dalį: baltymo seka gali būti žinoma, nors jo paskirtis dar nenustatyta. Funkcijos prognozė leidžia susiaurinti paiešką prieš imantis fizinių eksperimentų.

Pristatyme aprašytas kandidatas, kuriam numatomas aktyvumas prieš kvėpavimo takų ligų sukėlėjus. Jo savybės šiuo metu tikrinamos laboratorijoje; paskelbta informacija apima atrankos metodą ir tyrimo etapą, o ne registruoto vaisto sukūrimą.

Naujausi straipsniai

2 min. skaitymo • prieš 42 minutės

Lietuva investuoja į technologijų verslo talentus: septynių magistrantų studijoms – 49,3 tūkst. eurų

4 min. skaitymo • prieš 45 minutės

Prieš 476 tūkst. metų žmonių protėviai jau konstravo iš medžio: seniausias tokio tipo radinys

4 min. skaitymo • prieš 45 minutės

Kodėl automobilio akumuliatorius nusėda net važinėjant kasdien?

Visi naujausi straipsniai →

Šis projektas papildo kitus „Google“ DI taikymo mokslui darbus. Baltymų paieškoje modelio užduotis — iš didelės duomenų bazės pasiūlyti patikrinamas hipotezes, kurių vertę nustato eksperimentai.

Nuo algoritmo pasiūlymo iki vaisto – ilgas kelias

Didžiausias tokios paieškos privalumas yra galimybė sumažinti kandidatų skaičių: vietoj atsitiktinių tūkstančių junginių bandymų tyrėjai gali rinktis tuos, kurių biologinės funkcijos atrodo perspektyviausios. Tačiau prognozuotas antimikrobinis poveikis dar neįrodo, kad medžiaga saugi žmogui, pakankamai veiksminga organizme ar kad bakterijos jai neįgis atsparumo.

Laboratorijoje reikia atskirai patikrinti, ar kandidatas iš tiesų veikia mikroorganizmus, kokiomis koncentracijomis ir ar nepažeidžia žmogaus ląstelių. Net sėkmingas ankstyvas bandymas būtų tik pradžia. Todėl svarbu atskirti mokslinio atradimo metodą nuo medicinos praktikoje naudojamo preparato: bendrovės pristatymas kalba apie greitesnį hipotezių tikrinimą, o ne rinkai paruoštą antibiotiką.